Kliniska och molekylära egenskaper hos karbapenemresistent Hypervi

Javascript är för närvarande inaktiverat i din webbläsare.När javascript är inaktiverat kommer vissa funktioner på denna webbplats inte att fungera.
Registrera dina specifika uppgifter och specifika läkemedel av intresse, så matchar vi informationen du tillhandahåller med artiklar i vår omfattande databas och skickar dig en PDF-kopia via e-post i god tid.
Kliniska och molekylära egenskaper hos karbapenemresistent högvirulens Klebsiella pneumoniae på ett tertiärsjukhus i Shanghai
Zhou Cong, 1 Wu Qiang, 1 He Leqi, 1 Zhang Hui, 1 Xu Maosuo, 1 Bao Yuyuan, 2 Jin Zhi, 3 Fang Shen 11 Institutionen för klinisk laboratoriemedicin, Shanghai Fifth People's Hospital, Fudan University, Shanghai, Folkrepubliken Kina;2 Shanghai Jiaotong Department of Laboratory Medicine, Shanghai Children's Hospital, Shanghai, Folkrepubliken Kina;3 Department of Neurology, Shanghai Fifth People's Hospital, Fudan University. Motsvarande författare: Fang Shen, Department of Clinical Laboratory Medicine, Shanghai Fifth People's Hospital, Fudan University, Ruili Road 128, Minhang District, Shanghai, Postnummer 200240 i KinaTel +86 18026107322 E-post [email protected] Bakgrund: Sammanslagningen av karbapenemresistens och hypervirulens i Klebsiella pneumoniae har lett till stora folkhälsoutmaningar.Under de senaste åren har det kommit fler och fler rapporter om karbapenem-resistenta högvirulens Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) isolat.Material och metoder: En retrospektiv analys av klinisk datautvärdering av patienter infekterade med CR-hvKP från januari 2019 till december 2020 på ett tertiärt sjukhus.Beräkna Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae (hmKP), karbapenemresistent Klebsiella pneumoniae (CR-hmKP) och karbapenemresistent högvirulens lunginflammation insamlade inom 2 år Antalet isolat av Leberella (CR-hvKP).PCR-detektion av resistensgener, virulensrelaterade gener, kapsulära serotypgener och multilocus-sekvenstypning (MLST) av CR-hvKP-isolat.Resultat: Totalt 1081 icke-repetitiva Klebsiella pneumoniae-stammar isolerades under studien., Inklusive 392 stammar av Klebsiella pneumoniae (36,3%), 39 stammar av CR-hmKP (3,6%) och 16 stammar av CR-hvKP (1,5%).Cirka 31,2 % (5/16) av CR-hvKP kommer att isoleras under 2019, och cirka 68,8 % (11/16) av CR-hvKP kommer att isoleras under 2020. Bland de 16 CR-hvKP-stammarna är 13 stammar ST11 och stammar ST11 serotyp K64, 1 stam är ST11 och K47 serotyper, 1 stam är ST23 och K1 serotyper, och 1 stam är ST86 och K2 serotyper.De virulensrelaterade generna entB, fimH, rmpA2, iutA och iucA finns i alla 16 CR-hvKP isolat, följt av mrkD (n=14), rmpA (n=13), aerobactin (n=2) , AllS ( n=1).De 16 CR-hvKP-isolaten bär alla karbapenemasgenen blaKPC-2 och den utökade β-laktamasgenen blaSHV.Resultaten av ERIC-PCR DNA-fingeravtryck visade att 16 CR-hvKP-stammar var mycket polymorfa, och banden för varje stam var signifikant olika, vilket visade ett sporadiskt tillstånd.Slutsats: Även om CR-hvKP distribueras sporadiskt, ökar det år för år.år.Därför bör klinisk uppmärksamhet väckas och nödvändiga åtgärder bör vidtas för att undvika kloning och spridning av superbug CR-hvKP.Nyckelord: Klebsiella pneumoniae, karbapenemresistens, hög virulens, högt slem, epidemiologi
Klebsiella pneumoniae är en opportunistisk patogen som kan orsaka en mängd olika infektioner, inklusive lunginflammation, urinvägsinfektioner, bakteriemi och hjärnhinneinflammation.1 Under de senaste trettio åren, till skillnad från den klassiska Klebsiella pneumoniae (cKP), har ett nytt mycket virulent Klebsiella pneumoniae (hvKP) hypermukosalt slem blivit en kliniskt viktig patogen, som kan hittas i mycket aggressiva infektioner som leverbölder orsakas hos friska och immunförsvagade individer.2 Det är värt att notera att dessa infektioner vanligtvis åtföljs av destruktiva spridda infektioner, inklusive endoftalmit och meningit.3 Produktionen av hög mukosal slemhinnefenotyp hvKP beror vanligtvis på den ökade produktionen av kapselpolysackarider och närvaron av specifika virulensgener, såsom rmpA och rmpA2.4.Den höga slemfenotypen bestäms vanligtvis av "strängtestet".Klebsiella pneumoniae-kolonierna odlade över natten på blodagarplattor sträcks med en ögla.När ett trögflytande rep med en längd på >5 mm bildas är "reptestet" positivt.5 En nyligen genomförd studie visade att peg-344, iroB, iucA, rmpA rmpA2 och rmpA2 är biomarkörer som exakt kan identifiera hvkp.6 I denna studie definierades den mycket virulenta Klebsiella pneumoniae som att den hade en mycket slemviskös fenotyp (positivt strängtestresultat) och bär Klebsiella pneumoniae virulensplasmidrelaterade ställen (rmpA2, iutA, iucA). På 1980-talet beskrev Taiwans fallrapporter först -förvärvade leverbölder orsakade av hvKP, åtföljda av allvarliga ändorganskador, såsom hjärnhinneinflammation och endoftalmit.7,8 hvKP har sporadisk överföring i många länder i Asien, Europa och Amerika.Även om flera fall av hvKP har rapporterats i Europa och Amerika, förekom förekomsten av hvKP främst i asiatiska länder, särskilt Kina.9
I allmänhet är hvKP känsligare för antibiotika, medan karbapenemresistent Klebsiella pneumoni (CRKP) är mindre giftigt.Men med spridningen av läkemedelsresistens och virulensplasmider beskrevs CR-hvKP först av Zhang et al.under 2015, och det kommer fler och fler inhemska rapporter.10 Eftersom CR-hvKP kan orsaka allvarliga och svårbehandlade infektioner, om en pandemisk klon dyker upp, kan den bli nästa "superbug".Hittills har de flesta infektioner orsakade av CR-hvKP inträffat i sporadiska fall, och småskaliga utbrott är sällsynta.11,12
För närvarande är detektionshastigheten för CR-hvKP låg, och det finns få relaterade studier.Den molekylära epidemiologin för CR-hvKP är olika i olika regioner, så det är nödvändigt att studera den kliniska fördelningen och molekylära epidemiologiska egenskaperna hos CR-hvKP i denna region.Denna studie analyserade ingående resistensgener, virulensrelaterade gener och MLST av CR-hvKP.Vi försökte undersöka prevalensen och den molekylära epidemiologin av CR-hvKP på ett tertiärsjukhus i Shanghai, östra Kina.Denna studie är av stor betydelse för att förstå den molekylära epidemiologin av CR-hvKP i Shanghai.
De icke-repetitiva Klebsiella pneumoniae-isolaten från Shanghai Fifth People's Hospital anslutna till Fudan University från januari 2019 till december 2020 samlades in retrospektivt, och procentsatserna hmKP, CRKP, CR-hmkp och CR-hvKP beräknades.Alla isolat identifierades av VITEK-2 kompakt automatisk mikrobiell analysator (Biomerieux, Marcy L'Etoile, Frankrike).Maldi-Tof masspektrometri (Bruker Daltonics, Billerica, MA, USA) användes för att omkontrollera identifieringen av bakteriestammar.Den höga slemfenotypen bestäms av "strängtestet".När imipenem eller meropenem är resistent, bestäms karbapenemresistens genom ett läkemedelskänslighetstest.Mycket virulent Klebsiella pneumoniae definieras som att den har en fenotyp med hög slem (positivt strängtestresultat) och bär Klebsiella pneumoniae virulensplasmidrelaterade ställen (rmpA2, iutA, iucA)6.
En enda Klebsiella pneumoniae-koloni inokulerades på en 5% fårblodagarplatta.Efter inkubation över natten vid 37°C, dra försiktigt upp kolonin med en inokuleringsögla och upprepa 3 gånger.Om en viskös linje bildas tre gånger och längden är större än 5 mm anses "linjetestet" vara positivt och stammen har en hög slemfenotyp.
I den kompakta automatiska mikrobiella analysatorn VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, Frankrike) upptäcktes den antimikrobiella känsligheten för flera vanliga antibiotika genom mikroutspädning av buljong.Resultaten tolkas enligt vägledningsdokumentet utvecklat av Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI, 2019).E. coli ATCC 25922 och Klebsiella pneumoniae ATCC 700603 användes som kontroller för antimikrobiell känslighetstestning.
Genomiskt DNA från alla Klebsiella pneumoniae-isolat extraherades med TIANamp Bacteria Genomic DNA Kit (Tiangen Biotech Co. Ltd., Peking, Kina).β-laktamasgener med utökat spektrum (blaCTX-M, blaSHV och blaTEM), karbapenemasgener (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaIMP och blaOXA-48) och 9 representativa virulensrelaterade gener, inklusive pLVPK Plasmidliknande loci (allS, fimH) mrkD, entB, iutA, rmpA, rmpA2, iucA och aerobactin) amplifierades med PCR som tidigare beskrivits.13,14 Kapsulära serotypspecifika gener (K1, K2, K5, K20, K54 och K57) amplifierades med PCR såsom beskrivits ovan.14 Om negativ, amplifiera och sekvensera wzi-lokuset för att bestämma de kapsulära serotypspecifika generna.15 De primrar som används i denna studie listas i tabell S1.De positiva PCR-produkterna sekvenserades av NextSeq 500-sekvenseringsplattformen (Illumina, San Diego, CA, USA).Jämför nukleotidsekvenser genom att köra BLAST på NCBI:s webbplats (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).
Multi-site sequence typing (MLST) utfördes enligt beskrivningen på Pasteur Institute MLSTs webbplats (https://bigsdb.pasteur.fr/klebsiella/klebsiella.html).De sju hushållsgenerna gapA, infB, mdh, pgi, phoE, rpoB och tonB amplifierades med PCR och sekvenserades.Sekvenstypen (ST) bestäms genom att jämföra sekvenseringsresultaten med MLST-databasen.
Homologin för Klebsiella pneumoniae analyserades.Klebsiella pneumoniae genomiskt DNA extraherades som en mall, och ERIC-primrarna visas i tabell S1.PCR amplifierar genomiskt DNA och konstruerar ett fingeravtryck av genomiskt DNA.16 PCR-produkter detekterades genom 2% agarosgelelektrofores.Resultaten av DNA-fingeravtryck identifierades med hjälp av bandigenkänning av mjukvaran QuantityOne, och genetisk analys utfördes med den oviktade metoden för parad grupp (UPGMA) av aritmetiskt medelvärde.Isolaten med likhet > 75 % anses vara samma genotyp, och de med likhet <75 % anses vara olika genotyper.
Använd det statistiska mjukvarupaketet SPSS för Windows 22.0 för att analysera data.Data beskrivs som medelvärde ± standardavvikelse (SD).Kategoriska variabler utvärderades med chi-kvadrattest eller Fishers exakta test.Alla statistiska tester är tvåsidiga och ett P-värde på <0,05 anses vara statistiskt signifikant.
Shanghai Fifth People's Hospital anslutet till Fudan University samlade in 1081 Klebsiella pneumoniae-isolat från 1 januari 2019 till 31 december 2020, och exkluderade dubbla isolat från samma patient.Bland dem var 392 stammar (36,3%) hmKP, 341 stammar (31,5%) var CRKP, 39 stammar (3,6%) var CR-hmKP och 16 stammar (1,5%) var CR-hvKP.Det är värt att notera att 33,3% (13/39) av CR-hmKP och 31,2% (5/16) av CR-hvKP är från 2019, 66,7% (26/39) av CR-hmKP och 68,8% (11/16) ) CR-hvKP separerades från 2020. Från sputum (17 stammar), urin (12 stammar), dräneringsvätska (4 stammar), blod (2 stammar), pus (2 stammar), galla (1 isolering) och pleurautgjutning (1 isolering).Sexton typer av CR-hvKP återvanns från sputum (9 isolat), urin (5 isolat), blod (1 isolat) och pleurautgjutning (1 isolat).
Genom stamidentifiering, läkemedelskänslighetstest, strängtest och virulensrelaterad gendetektion screenades 16 CR-hvKP-stammar.De kliniska egenskaperna hos de 16 patienter infekterade med CR-hvKP-isolat sammanfattas i tabell 1. 13 av de 16 patienterna (81,3%) var män och alla patienter var äldre än 62 år (medelålder: 83,1±10,5 år).De kom från 8 avdelningar och mer än hälften kom från den centrala ICU (9 fall).Grundläggande sjukdomar inkluderar cerebrovaskulär sjukdom (75 %, 12/16), hypertoni (50 %, 8/16), kronisk obstruktiv lungsjukdom (50 %, 8/16), etc. Invasiv kirurgi inkluderar mekanisk ventilation (62,5 %, 10/ 16), urinkateter (37,5 %, 6/16), magsond (18,8 %, 3/16), kirurgi (12,5 %, 2/16) och intravenös kateter (6,3 %, 1/16).Nio av de 16 patienterna dog och 7 patienter förbättrades och skrevs ut.
De 39 CR-hmKP-isolaten delades upp i två grupper enligt längden på den klibbiga strängen.Bland dem delades 20 CR-hmKP-isolat med viskös stränglängd ≤ 25 mm upp i en grupp och 19 CR-hmKP-isolat med viskös stränglängd > 25 mm delades upp i en annan grupp.PCR-metoden detekterar den positiva graden av virulensrelaterade gener rmpA, rmpA2, iutA och iucA.De positiva frekvenserna av CR-hmKP-virulensrelaterade gener i de två grupperna visas i tabell 2. Det fanns ingen statistisk skillnad i den positiva frekvensen av CR-hmKP-virulensrelaterade gener mellan de två grupperna.
Tabell 3 listar de detaljerade profilerna för antimikrobiell resistens för de 16 läkemedlen.16 CR-hvKP-isolat visade multiläkemedelsresistens.Alla isolat behandlades med ampicillin, ampicillin/sulbaktam, cefoperazon/sulbaktam, piperacillin/tazobactam, cefazolin, cefuroxim, ceftazidim, ceftriaxon, cefepim, cefoxitin, imipenem och meropenem är resistenta.Trimetoprim-sulfametoxazol hade den lägsta resistensgraden (43,8 %), följt av amikacin (62,5 %), gentamicin (68,8 %) och ciprofloxacin (87,5 %).
Fördelningen av virulensrelaterade gener, antimikrobiella resistensgener, kapsulära serotypgener och MLST av 16 CR-hvKP isolat visas i figur 1. Resultaten av agarosgelelektrofores av vissa virulensrelaterade gener, antimikrobiella resistensgener och kapselserotypgener är visas i figur 1. Figur 2. MLST-analys visar totalt 3 ST, ST11 är den mest dominerande ST (87,5%, 14/16), följt av ST23 (6,25%, 1/16) och ST86 (6,25%, 1) /16).Enligt resultaten av wzi-typning identifierades 4 olika kapselserotyper (Figur 1).Bland de 16 karbapenemresistenta hvKP-isolaten är K64 den vanligaste serotypen (n=13), följt av K1 (n=1), K2 (n=1) och K47 (n=1).Dessutom är den kapselserotyp K1-stammen ST23, den kapsulära serotyp-K2-stammen är ST86, och de återstående 13 stammarna av K64 och 1 stam av K47 är alla ST11.De positiva frekvenserna av 9 virulensgener i 16 CR-hvKP-isolat visas i figur 1. , De virulensrelaterade generna entB, fimH, rmpA2, iutA och iucA finns i 16 CR-hvKP-stammar, följt av mrkD (n = 14), rmpA (n = 13), aerobakterin (n = 2), AllS (n=1).De 16 CR-hvKP-isolaten bär alla karbapenemasgenen blaKPC-2 och den utökade β-laktamasgenen blaSHV.16 CR-hvKP-isolat bar inte karbapenemgener blaNDM, blaVIM, blaIMP, blaOXA-48 och utökade β-laktamasgener blaTEM, blaCTX-M-2-gruppen och blaCTX-M-8-gruppen.Bland de 16 CR-hvKP-stammarna bar 5 stammar den utökade β-laktamasgenen blaCTX-M-1-gruppen, och 6 stammarna bar den utökade β-laktamasgenen blaCTX-M-9-gruppen.
Figur 1 De virulensrelaterade generna, generna för antimikrobiell resistens, kapsulära serotypgener och MLST från 16 CR-hvKP-isolat.
Figur 2 Agarosgelelektrofores av vissa virulensrelaterade gener, gener för antimikrobiell resistens och kapsulära serotypgener.
Notera: M, DNA-markör;1, blaKPC (893 bp);2, entB (400 bp);3, rmpA2 (609 bp);4, rmpA (429 bp);5, iucA (239 bp);6, iutA (880 bp);7, Aerobacterin (556 bp);8, Kl (1283 bp);9, K2 (641 bp);10, alla S (508 bp);11, mrkD (340 bp);12, fimH (609 bp).
ERIC-PCR användes för att analysera homologin för 16 CR-hvKP-isolat.Efter PCR-amplifiering och agarosgelelektrofores finns det 3-9 DNA-fragment.Fingeravtrycksresultaten visade att 16 CR-hvKP-isolat var mycket polymorfa, och det fanns uppenbara skillnader mellan isolaten (Figur 3).
De senaste åren har det kommit fler och fler rapporter om CR-hvKP-isolat.Utseendet på CR-hvKP-isolat utgör ett stort hot mot folkhälsan eftersom de kan orsaka allvarliga, svårbehandlade infektioner hos friska människor.I denna studie studerades prevalensen och molekylära epidemiologiska egenskaper hos CR-hvKP på ett tertiärt sjukhus i Shanghai från 2019 till 2020 för att bedöma om det finns en risk för CR-hvKP-utbrott och dess utvecklingstrend inom detta område.Samtidigt kan denna studie ge en mer omfattande utvärdering av klinisk smittsamhet, vilket är av stor betydelse för att förhindra vidare spridning av sådana isolat.
Denna studie analyserade retrospektivt den kliniska fördelningen och trenden av CR-hvKP från 2019 till 2020. Från 2019 till 2020 visade CR-hvKP isolat en ökande trend.Ungefär 31,2 % (5/16) av CR-hvKP isolerades 2019 och 68,8 % (11/16) av CR-hvKP isolerades 2020, vilket överensstämmer med den uppåtgående trenden för CR-hvKP som rapporterats i litteraturen.Eftersom Zhang et al.CR-hvKP beskrevs första gången 2015,10 mer och mer CR-hvKP-litteratur har rapporterats, 17-20 främst i Asien-Stillahavsområdet, särskilt i Kina.CR-hvKP är en superbakterie med supervirulens och multiläkemedelsresistens.Det är skadligt för människors hälsa och har en hög dödlighet.Därför bör uppmärksamhet ägnas och åtgärder bör vidtas för att förhindra spridning.
Antibiotikaresistensanalysen av 16 CR-hvKP isolat visade en hög grad av antibiotikaresistens.Alla isolat behandlades med ampicillin, ampicillin/sulbaktam, cefoperazon/sulbaktam, piperacillin/tazobactam, cefazolin, cefuroxim, ceftazidim, ceftriaxon, cefepim, cefoxitin, imipenem och meropenem är resistenta.Trimetoprim-sulfametoxazol hade den lägsta resistensgraden (43,8 %), följt av amikacin (62,5 %), gentamicin (68,8 %) och ciprofloxacin (87,5 %).Resistanshastigheten för CR-hmkp som studerats av Lingling Zhan och andra liknar denna studie [12].Patienter infekterade med CR-hvKP har många grundläggande sjukdomar, låg immunitet och svag oberoende steriliseringsförmåga.Därför är snabb behandling baserad på resultaten av det antimikrobiella känslighetstestet mycket viktigt.Vid behov kan den infekterade platsen hittas och behandlas med dränering, debridering och andra metoder.
De 39 CR-hmKP-isolaten delades upp i två grupper enligt längden på den klibbiga strängen.Bland dem delades 20 CR-hmKP-isolat med viskös stränglängd ≤ 25 mm upp i en grupp och 19 CR-hmKP-isolat med viskös stränglängd > 25 mm delades upp i en annan grupp.Vid jämförelse av de positiva frekvenserna av CR-hmKP virulensrelaterade gener mellan de två grupperna, fanns det ingen statistiskt signifikant skillnad i de positiva frekvenserna av virulensgener mellan de två grupperna.Forskning av Lin Ze et al.visade att den positiva graden av virulensgener för Klebsiella pneumoniae var signifikant högre än den för klassiska Klebsiella pneumoniae.21 Huruvida den positiva graden av virulensgener är positivt korrelerad med längden på den klibbiga kedjan är dock oklart.Andra studier har visat att den klassiska Klebsiella pneumoniae också kan vara en mycket virulent Klebsiella pneumoniae, med en högre positiv frekvens av virulensgener.22 Denna studie fann att virulensgenens positiva frekvens av CR-hmKP inte är positivt korrelerad med längden på slem.Sträng (eller ökar inte med längden på det klibbiga snöret).
ERIC PCR-fingeravtrycken i denna studie är polymorfa och det finns ingen klinisk korsning mellan patienter, så 16 patienter med CR-hvKP-infektion är sporadiska fall.Tidigare har de flesta infektioner orsakade av CR-hvKP rapporterats som isolerade eller sporadiska fall, 23,24 och småskaliga utbrott av CR-hvKP är sällsynta i litteraturen.11,25 ST11 är den vanligaste ST11 i CRKP och CR-hvKP isolat i Kina.26,27 Även om ST11 CR-hvKP stod för 87,5 % (14/16) av de 16 CR-hvKP-isolaten i denna studie, kan det inte antas att de 14 ST11 CR-hvKP-stammarna är från samma klon, så ERIC PCR-fingeravtryck krävs.Homologianalys.
I denna studie genomgick alla 16 patienter infekterade med CR-hvKP invasiv kirurgi.Enligt rapporter indikerar det dödliga utbrottet av ventilatorrelaterad lunginflammation orsakad av CR-hvKP11 att invasiva procedurer kan öka risken för CR-hvKP-infektion.Samtidigt har 16 patienter infekterade med CR-hvKP underliggande sjukdomar, varav cerebrovaskulära sjukdomar är de vanligaste.En tidigare studie visade att cerebrovaskulär sjukdom är en signifikant oberoende riskfaktor för CR-hvKP-infektion.28 Orsaken till detta fenomen kan vara den försvagade immuniteten hos patienter med cerebrovaskulär sjukdom, de patogena bakterierna kan inte uteslutas oberoende, och man litar bara på deras bakteriedödande effekt.Antibiotika kommer på sikt att leda till en kombination av multiläkemedelsresistens och hypervirulens.Bland de 16 patienterna dog 9 och dödligheten var 56,3 % (9/16).Dödligheten är högre än 10,12 i tidigare studier och lägre än 11,21 rapporterade i tidigare studier.Medelåldern för 16 patienter var 83,1±10,5 år, vilket tyder på att äldre är mer mottagliga för CR-hvKP.Tidigare studier har visat att unga människor är mer mottagliga för infektion.Virulensen hos Klebsiella pneumoniae.29 Andra studier har dock visat att äldre är mottagliga för den mycket virulenta Klebsiella pneumoniae24,28.Denna studie överensstämmer med detta.
Bland de 16 CR-hvKP-stammarna, förutom en ST23 CR-hvKP och en ST86 CR-hvKP, är de andra 14 stammarna alla ST11 CR-hvKP.Den kapsulära serotypen som motsvarar ST23 CR-HVKP är K1, och den motsvarande kapselserotypen av ST86 CR-HVKP är K2, liknande tidigare studier.30-32 patienter infekterade med ST23 (K1) CR-hvKP eller ST86 (K2) CR-hvKP dog, och dödligheten (100%) var signifikant högre än för patienter infekterade med ST11 CR-hvKP (50%).Såsom visas i figur 1 är den positiva frekvensen för ST23 (K1) eller ST86 (K2) stammar av virulensrelaterade gener högre än för ST11 (K64) stammar.Dödligheten kan vara relaterad till den positiva graden av virulensrelaterade gener.I denna studie bär 16 stammar av CR-hvKP alla karbapenemasgenen blaKPC-2 och den utökade β-laktamasgenen blaSHV.blaKPC-2 är den vanligaste karbapenemasgenen i CR-hvKP i Kina.33 I studien av Zhao et al., är 25blaSHV den utökade spektrum β-laktamasgenen med den högsta positiva frekvensen.Virulensgenerna entB, fimH, rmpA2, iutA och iucA finns i alla 16 CR-hvKP isolat, följt av mrkD (n=14), rmpA (n=13), anaerobicin (n=2), allS (n = 1), vilket liknar den tidigare studien.34 Vissa studier har visat att rmpA och rmpA2 (modulatorer av slemfenotypgener) kan främja utsöndringen av kapselpolysackarider, vilket leder till hypermucoida fenotyper och ökad virulens.35 Aerobakterier kodas av iucABCD-genen och deras homologa receptorer kodas av iutA-genen, så de har en högre nivå av virulens i G. mellonella-infektionsanalysen.allS är en markör för K1-ST23, inte i pLVPK, pLVPK är en virulensplasmid från supervirulenstyp K2.allS är en transkriptionsaktivator av HTH-typ.Dessa virulensgener är kända för att bidra till virulens och är ansvariga för kolonisering, invasion och patogenicitet.36
Denna studie beskriver prevalensen och den molekylära epidemiologin av CR-hvKP i Shanghai, Kina.Även om infektionen orsakad av CR-hvKP är sporadisk ökar den år för år.Resultaten stödjer tidigare forskning och visar att ST11 CR-hvKP är den mest populära CR-hvKP i Kina.ST23 och ST86 CR-hvKP visade högre virulens än ST11 CR-hvKP, även om de båda är mycket virulenta Klebsiella pneumoniae.När andelen mycket virulenta Klebsiella pneumoniae ökar, kan resistensgraden för Klebsiella pneumoniae minska, vilket kommer att leda till blind optimism i klinisk praxis.Därför är det nödvändigt att studera virulens och läkemedelsresistens hos Klebsiella pneumoniae.
Denna studie godkändes av den medicinska etiska kommittén vid Shanghai Fifth People's Hospital (nr 104, 2020).Kliniska prover är en del av rutinmässiga sjukhuslaboratorieprocedurer.
Tack till all personal på Central Laboratory of Shanghai Fifth People's Hospital för att de tillhandahållit teknisk vägledning för denna studie.
Detta arbete stöddes av Natural Science Foundation i Minhang District, Shanghai (godkännandenummer: 2020MHZ039).
1. Navon-Venezia S, Kondratyeva K, Carattoli A. Klebsiella pneumoniae: den viktigaste globala källan och skytteln för antibiotikaresistens.FEMS Microbiology Revided Edition 2017;41(3): 252–275.doi:10.1093/femsre/fux013
2. Prokesch BC, TeKippe M, Kim J, etc. Primär osteomyelit orsakad av hög toxicitet.Lanceten är infekterad med Dis.2016;16(9):e190–e195.doi:10.1016/S1473-3099(16)30021-4
3. Shon AS, Bajwa RPS, Russo TA.Hög virulens (super slem).Klebsiella pneumoniae virulens.2014;4(2): 107–118.doi:10.4161/viru.22718
4. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: Fortsätt offensiven med ett starkt försvar.Microbiol Mol Biol Rev. 2016;80(3):629–661.doi:10.1128/MMBR.00078-15
5. Fang C, Chuang Y, Shun C, et al.Nya virulensgener av Klebsiella pneumoniae som orsakar primär leverabscess och metastaserande komplikationer av sepsis.J Exp Med.2004;199(5):697–705.doi:10.1084/jem.20030857
6. Russo TA, Olson R, Fang CT, etc. Identifiering av J Clin Microbiol, en biomarkör som används för att skilja mycket virulent Klebsiella pneumoniae från klassisk Klebsiella pneumoniae.2018;56(9):e00776.
7. YCL, Cheng DL, Lin CL.Klebsiella pneumoniae leverabscess associerad med infektiös endoftalmit.Arch praktikant läkare.1986;146(10):1913-1916.doi:10.1001/archinte.1986.00360220057011
8. Chiu C, Lin D, Liaw Y. Metastatisk septisk endoftalmit i purulent leverabscess.J Klinisk gastroenterologi.1988;10(5):524–527.doi:10.1097/00004836-198810000-00009
9. Guo Yan, Wang Shun, Zhan Li, etc. Mikrobiologiska och kliniska egenskaper hos höga mucinösa Klebsiella pneumoniae-isolat associerade med invasiva infektioner i Kina.Förcellerna är infekterade med mikroorganismer.2017;7.
10. Zhang Yi, Zeng Jie, Liu Wei, etc. Uppkomsten av en mycket virulent stam av karbapenemresistent Klebsiella pneumoniae vid kliniska infektioner i Kina[J].J infektion.2015;71(5): 553–560.doi:10.1016/j.jinf.2015.07.010
11. Gu De, Dong Nan, Zheng Zhong, etc. Ett dödligt utbrott av ST11 karbapenem-resistent högvirulens Klebsiella-lunginflammation på ett kinesiskt sjukhus: en molekylär epidemiologisk studie.Lanceten är infekterad med Dis.2018;18(1):37–46.doi:10.1016/S1473-3099(17)30489-9
12. Zhan Li, Wang S, Guo Yan, et al.Ett utbrott av karbapenem-resistent stam ST11 hypermucoid Klebsiella pneumoniae på ett tertiärt sjukhus i Kina.Förcellerna är infekterade med mikroorganismer.2017;7.
13. FRE, Messai Y, Alouache S, etc. Klebsiella pneumoniae virulensspektrum och läkemedelskänslighetsmodell isolerade från olika kliniska prover[J].Patofysiologi.2013;61(5):209-216.doi:10.1016/j.patbio.2012.10.004
14. Turton JF, Perry C, Elgohari S, etc. PCR-karakterisering och typning av Klebsiella pneumoniae med användning av kapseltypspecificitet, variabelt antal tandemupprepningar och virulensgenmål[J].J Med Microbiology.2010;59 (kapitel 5): 541–547.doi:10.1099/jmm.0.015198-0
15. Brisse S, Passet V, Haugaard AB, etc. Wzi-gensekvensering, en snabb metod för att bestämma typen av Klebsiella-kapsel[J].J Klinisk mikrobiologi.2013;51(12):4073-4078.doi:10.1128/JCM.01924-13
16. Ranjbar R, Tabatabaee A, Behzadi P, etc. E. coli-stammar isolerade från olika fekala djurprover, enterobakterier repetitiv gentypning konsensuspolymeraskedjereaktion (ERIC-PCR) genotypning[J].Iran J Pathol.2017;12(1): 25–34.doi:10.30699/ijp.2017.21506